MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10B

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017648	GTT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017648	T	7	7	43	49	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017648	TGA	2	6	58	63	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017648	TTG	2	6	102	107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017648	TGTT	2	8	110	117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017648	T	6	6	116	121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017648	T	6	6	144	149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017648	TGTC	2	8	279	286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017648	ATT	3	9	363	371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017648	GTT	2	6	390	395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017648	CAAC	2	8	402	409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017648	TTG	2	6	419	424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017648	T	7	7	452	458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017648	GTT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017648	T	6	6	526	531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017648	T	9	9	609	617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017648	T	6	6	823	828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017648	GTAC	2	8	861	868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017648	AAAC	2	8	949	956	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017648	GTCG	2	8	1011	1018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017648	GGAA	2	8	1026	1033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017648	GAA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627432
23	NC_017648	GAT	2	6	1100	1105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627432
24	NC_017648	GC	4	8	1138	1145	0 %	0 %	50 %	50 %	386627432
25	NC_017648	CAG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627432
26	NC_017648	CTGG	2	8	1189	1196	0 %	25 %	50 %	25 %	386627432
27	NC_017648	TG	3	6	1386	1391	0 %	50 %	50 %	0 %	386627432
28	NC_017648	CGT	2	6	1532	1537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386627432
29	NC_017648	TCTAAG	2	12	1841	1852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386627432
30	NC_017648	GCA	2	6	1854	1859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627432
31	NC_017648	GCAC	2	8	1874	1881	25 %	0 %	25 %	50 %	386627432
32	NC_017648	A	6	6	1934	1939	100 %	0 %	0 %	0 %	386627432
33	NC_017648	GTAGA	2	10	1949	1958	40 %	20 %	40 %	0 %	386627432
34	NC_017648	AGC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017648	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017648	TGG	2	6	2071	2076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017648	CGC	2	6	2084	2089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017648	AGCG	2	8	2108	2115	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017648	T	6	6	2230	2235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017648	ATAGC	2	10	2236	2245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017648	CGT	2	6	2321	2326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017648	T	7	7	2329	2335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017648	TTCG	2	8	2364	2371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017648	T	7	7	2393	2399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017648	AAT	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017648	TGA	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017648	ATCCG	2	10	2517	2526	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017648	TTC	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017648	T	7	7	2580	2586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017648	GT	3	6	2590	2595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017648	CGG	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017648	GAAG	2	8	2667	2674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017648	TC	3	6	2689	2694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017648	TCG	2	6	2697	2702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017648	TGG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627433
56	NC_017648	GGC	2	6	2903	2908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627433
57	NC_017648	CGG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627433
58	NC_017648	ATG	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
59	NC_017648	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
60	NC_017648	CTCA	2	8	3225	3232	25 %	25 %	0 %	50 %	386627433
61	NC_017648	ACG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386627433
62	NC_017648	TGA	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
63	NC_017648	CAT	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386627433
64	NC_017648	ATG	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386627433
65	NC_017648	GA	3	6	3581	3586	50 %	0 %	50 %	0 %	386627433
66	NC_017648	CAGA	2	8	3596	3603	50 %	0 %	25 %	25 %	386627433
67	NC_017648	AGA	2	6	3676	3681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386627434
68	NC_017648	AGTC	2	8	3915	3922	25 %	25 %	25 %	25 %	386627434
69	NC_017648	ACA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386627434
70	NC_017648	TGGG	2	8	4029	4036	0 %	25 %	75 %	0 %	386627434
71	NC_017648	TG	3	6	4064	4069	0 %	50 %	50 %	0 %	386627434
72	NC_017648	GCG	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386627434
73	NC_017648	TGG	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386627434
74	NC_017648	CGCTT	2	10	4201	4210	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017648	T	7	7	4258	4264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017648	TCTG	2	8	4274	4281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017648	TA	4	8	4321	4328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017648	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017648	T	6	6	4381	4386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017648	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017648	ATG	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017648	TAT	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017648	TAT	2	6	4521	4526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017648	A	6	6	4546	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017648	TTGT	2	8	4604	4611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017648	TAA	2	6	4638	4643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017648	TACT	2	8	4652	4659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017648	ATGGA	2	10	4692	4701	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017648	A	6	6	4726	4731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017648	TTA	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017648	GTT	3	9	4754	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017648	TGTA	2	8	4770	4777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017648	TA	3	6	4776	4781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017648	T	8	8	4840	4847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017648	ATTA	2	8	4851	4858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017648	T	8	8	5035	5042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017648	TG	3	6	5051	5056	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017648	A	6	6	5078	5083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017648	TG	3	6	5134	5139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.